Le monde a été dévasté, les humains sont tous morts... enfin presque tous. Seto est le héros du jeu et son objectif est celui de partir à la recherche des survivants parmi toutes ses ruines. Un jour il rencontrera une fille aux cheveux argentés, Ren. Malheureusement pour lui, la jeune demoiselle va s'enfuir. Maintenant qu'il sait qu'il n'est plus seul, il doit la retrouver, même si plein de monstres (fantômes, androïdes ect...) l'attaqueront. Pendant son voyage, Seto rencontra des personnes non humaines qui deviendront par la suite ses amis (au début une sorte d'ordinateur, ensuite Crow un voleur, ect...)